Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CSNK1DP48730 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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