Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCR1P32246 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCR1P32246 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms