Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms