Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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PTPREP23469 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPREP23469 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPREP23469 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPREP23469 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPREP23469 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPREP23469 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPREP23469 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPREP23469 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPREP23469 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPREP23469 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPREP23469 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPREP23469 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPREP23469 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPREP23469 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPREP23469 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPREP23469 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPREP23469 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPREP23469 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPREP23469 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
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PTPREP23469 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PTPREP23469 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPREP23469 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPREP23469 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPREP23469 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPREP23469 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPREP23469 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPREP23469 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPREP23469 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPREP23469 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PTPREP23469 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPREP23469 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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PTPREP23469 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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PTPREP23469 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPREP23469 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPREP23469 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPREP23469 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPREP23469 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPREP23469 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPREP23469 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPREP23469 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPREP23469 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPREP23469 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPREP23469 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPREP23469 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPREP23469 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPREP23469 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPREP23469 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPREP23469 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPREP23469 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPREP23469 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPREP23469 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPREP23469 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPREP23469 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPREP23469 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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