Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ITGB6P18564 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms