Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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PTPRAP18433 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRAP18433 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
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