Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
UBL4AP11441 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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UBL4AP11441 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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UBL4AP11441 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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UBL4AP11441 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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UBL4AP11441 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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UBL4AP11441 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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UBL4AP11441 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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UBL4AP11441 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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UBL4AP11441 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBL4AP11441 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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