Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
C4BP0C0L5 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
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