Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTMAP06454 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTMAP06454 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTMAP06454 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms