Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYBBP04839 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYBBP04839 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYBBP04839 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYBBP04839 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CYBBP04839 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CYBBP04839 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYBBP04839 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CYBBP04839 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYBBP04839 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYBBP04839 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYBBP04839 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYBBP04839 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYBBP04839 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CYBBP04839 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYBBP04839 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CYBBP04839 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CYBBP04839 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms