Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EGFR-AS1-201ENST00000442411 2806 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CADM1-206ENST00000537058 3550 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC126564.1-201ENST00000623628 2013 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGED1-201ENST00000326587 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM230B-208ENST00000451257 3566 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WSCD2-201ENST00000332082 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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