Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ODF3BA8MYP8 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms