Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 PTCH1-207ENST00000429896 6563 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 ADIRF-AS1-203ENST00000609111 3822 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 NBPF1-203ENST00000430580 5932 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA1F-203ENST00000376265 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM230B-208ENST00000451257 3566 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 AC073335.2-201ENST00000610177 3441 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 CEP68-201ENST00000260569 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 PCDHGA6-201ENST00000517434 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 ESR2-213ENST00000557772 5458 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 ZKSCAN3-203ENST00000377255 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms