Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNF0

PACSIN2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN2Q9UNF0 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACSIN2Q9UNF0 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms