Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms