Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CTSFQ9UBX1 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CTSFQ9UBX1 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CTSFQ9UBX1 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CTSFQ9UBX1 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTSFQ9UBX1 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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