Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
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USP35Q9P2H5 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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