Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MBD5Q9P267 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.9 ms