Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms