Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TMEM27Q9HBJ8 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms