Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
POLR2J2Q9GZM3 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms