Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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