Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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FOXQ1Q9C009 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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FOXQ1Q9C009 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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