Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ABL2-204ENST00000502732 12144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1F-201ENST00000323022 6037 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 CSPG4P12-201ENST00000558282 4853 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ROBO2-209ENST00000487694 5919 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 IPO7-201ENST00000379719 6191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 COBLL1-202ENST00000375458 9367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 DNMT1-202ENST00000359526 5206 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 SMIM10L1-201ENST00000622602 4795 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ETNK1-201ENST00000266517 7159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 CEP170-203ENST00000366543 6727 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 STX16-202ENST00000355957 4897 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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MAP1LC3CQ9BXW4 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFHX2-202ENST00000419474 9182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 MADD-209ENST00000406482 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF10-205ENST00000518288 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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