Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SRRTQ9BXP5 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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