Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms