Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LRRIQ1Q96JM4 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms