Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms