Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG16L2Q8NAA4 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms