Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPUSD2Q8IZ73 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms