Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPAP2Q8IXW5 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms