Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP6

MICAL3, [F-actin]-monooxygenase MICAL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAL3Q7RTP6 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms