Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPX1

TBC1D3C, TBC1 domain family member 3C, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D3CQ6IPX1 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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TBC1D3CQ6IPX1 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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TBC1D3CQ6IPX1 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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TBC1D3CQ6IPX1 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TBC1D3CQ6IPX1 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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