Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATG16L1Q676U5 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms