Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms