Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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GEN1Q17RS7 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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GEN1Q17RS7 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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GEN1Q17RS7 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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GEN1Q17RS7 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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GEN1Q17RS7 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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GEN1Q17RS7 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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GEN1Q17RS7 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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GEN1Q17RS7 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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GEN1Q17RS7 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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GEN1Q17RS7 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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GEN1Q17RS7 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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