Protein–RNA interactions for Protein: Q17RQ9

NKPD1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKPD1Q17RQ9 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NKPD1Q17RQ9 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms