Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDO1Q16878 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDO1Q16878 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms