Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DDB1Q16531 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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