Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SIX1Q15475 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SIX1Q15475 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SIX1Q15475 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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SIX1Q15475 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SIX1Q15475 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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