Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ITGA9Q13797 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ITGA9Q13797 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ITGA9Q13797 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ITGA9Q13797 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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ITGA9Q13797 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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ITGA9Q13797 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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ITGA9Q13797 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ITGA9Q13797 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ITGA9Q13797 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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