Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOFQ13790 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOFQ13790 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
APOFQ13790 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOFQ13790 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOFQ13790 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOFQ13790 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOFQ13790 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
APOFQ13790 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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APOFQ13790 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOFQ13790 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOFQ13790 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOFQ13790 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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APOFQ13790 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOFQ13790 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOFQ13790 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOFQ13790 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOFQ13790 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOFQ13790 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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APOFQ13790 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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APOFQ13790 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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APOFQ13790 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
APOFQ13790 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOFQ13790 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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APOFQ13790 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOFQ13790 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOFQ13790 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOFQ13790 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOFQ13790 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOFQ13790 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
APOFQ13790 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
APOFQ13790 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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