Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP1A4Q13733 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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