Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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