Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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