Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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FOXD4Q12950 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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FOXD4Q12950 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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FOXD4Q12950 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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FOXD4Q12950 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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