Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms