Protein–RNA interactions for Protein: Q08AD1

CAMSAP2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP2Q08AD1 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAMSAP2Q08AD1 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAMSAP2Q08AD1 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms