Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms