Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms